Para inutilizar a nota fiscal, vá em Vendas > Emitir NF-e
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Localize a numeração de nota que precisa ser inutilizada na listagem. Ela deverá aparecer como "NF Não Encontrada". Assim, basta clicar no botão "Inutilizar Nota Fiscal".
Preencha o motivo desta anulação e depois clique em "Inutilizar Numeração".
Pronto! A Conta Azul validará as informações do seu certificado e enviará à Secretaria da Fazenda (SEFAZ) as informações, assim, prestando conta desta numeração que não foi utilizada.